אבי גנון סיים היום את תפקידו כמשנה למנכ"ל משרד החינוך. באירוע הפרידה שנערך לכבודו בקרב עובדי המשרד אמר: "אם גם אתם חשים שמשהו גדול נעצר באבחה אחת - סימן שהמשמרת שלנו עשתה משהו טוב למערכת החינוך. עשינו יחד כמה דברים גדולים בזמן קצר ועל כך תודתי לשרה היוצאת ד"ר יפעת שאשא ביטון ולמנכ"לית היוצאת דלית שטואבר שנתנו בי אמון מלא להוביל ולהשפיע. המשמרת הבאה כבר כאן. רוב עמדות המפתח כבר נתפסו ומעכשיו הם רבי החובלים (או בעצם הטייסים) של משרד החינוך. כאחרון הבכירים של המשמרת היוצאת, כל בקשתי היא לשמור על מה שנעשה במידת האפשר ולהשלים את מה שהתחלנו".
בתקופת כהונתו במשרד החינוך כיהן כיו"ר הועדה לחיים משותפים וכיו"ר הועדה להסדרת פעילות אולפני העברית. היה אחראי על ביצוע פרויקטי תשתית נרחבים בכפרי הנוער. בנוסף הקים את הרשות ומנהלת ילדי הפזורה הבדואית, היה פרויקטור תהליך שילובם וקליטתם של 10000 ילדים מאוקראינה, והיה אמון על הקשר עם החינוך היהודי בתפוצות.
יואב קיש, שר החינוך הנכנס, ויואב צלאל, מנכ"ל משרדו, הודו לגנון על תרומתו הרבה בתקופה בה שימש כמשנה למנכ"ל המשרד וביקשו שימשיך לתרום מנסיונו למערכת.
גנון צפוי לנהל בקרוב את אחת מקרנות הפילנתרופיה הגדולות בישראל הפועלת בתחומי החינוך והחברה.